(Ayuda) Presentación con after effects

Buen día señores, soy nuevo en la comunidad espero integrarme propiamente en los foros, verán tengo una duda, mas que nada me he auto impuesto un trabajo que quizás sea complicado o no o simplemente no se pueda hacer, he hecho una intro con after effects que es para una presentación. el intro muestra el logotipo y he hecho un loop en cierta parte del intro para que esa parte siga repitiéndose porque en teoría yo estaría dando la bienvenida y hablando en ese lapso de tiempo. mi duda es, si es posible de alguna manera tener el control de ese loop para en el momento que yo quiera se ejecutara otra animación y pasar a otra parte de la presentación y pasar a otro punto en el tema. espero me haya explicado

¿Se puede?
¿mejor lo hago con vídeos separados?
¿utilizo otro software.?

¿o que me recomiendan?

de antemano gracias.

a ver si lo he entendido bien, tú quieres hacer un vídeo en el que tú vas hablando y, para entendernos fácilmente, tienes el logotipo que está continuamente moviéndose, y quieres que en cierto momento ese logo cambie por otra cosa o un vídeo nuevo??