Dos cuestiones a tener en cuenta para el uso de la propiedad
z-index y el flash:
1ª: sólo se aplica a los elementos posicionados. Esto es, sobre aquellos que no hayas definido una posición (position) no, ya que el valor por defecto es static.
2ª: para que los objetos flash se vean afectados por z-index debes declararles el vmode=transparent
Una búsqueda simple te arrojará múltiples resultados y ejemplos, pues es un tema recurrente.
Saludos