Depende de para que vayas a usar el informe, puedes hacer como te dijeron antes, un Manual de Usuario, en el cual explicas como funciona todo, las secciones, el mapa general del sitio.
Igualmente (y vuelvo y repito que todo depende del objetivo final del informe) puedes hacer uno en el que describas la pagina en terminos técnicos y de diseño, que estilos usas, tipo de imagenes, que cosas están permitidas hacer con el diseño y cuales no, más al estilo de un Manual de Imagen Corporativa para tu pagina (bueno, esa es la idea)
Y fianlmente puedes hacer un informe de las actividades que realizaste para llegar al resultado, con un cronograma en el que especificas estas tareas, el tiempo que te demoraste en cada una de ellas, los resultados, observaciones, quien estuvo a cargo de realizarlas.
Como ves, todo depende cual es el objetivo final y a quién va dirigido