Consejos diseño y codigo php

Hola a todos soy nuevo por aquí me gustaria saber vuestra opinión con respecto a la organización del diseño y código Html y Php, y como puede afectar a la velocidad de carga de un sitio web. que me recomendais o que patrón sería el óptimo para que quede todo bien organizado y o tener muchos archivos.

Saludos!

Jorge

Además de lo obvio: el peso de los archivos, lo que más influye en la velocidad de carga es la cantidad de peticiones que el navegador tiene que hacer al sitio.

cuando consultes a una DB a no ser que sea necesario no hagas Select * ya que traes mas info de la que necesitas.
Ten indices apropiados en tus tablas.
Imágenes optimizadas y css no sobrecargado
El usar un framework permite optimizar desempeño agregando cache o otras arandelas a tu website