No tiene que agarrar el tamaño del contenedor, pero si el del archivo original algo debe estar pasando alli.
Puedes acceder a sus width y height pero una vez cargado no antes.
Código ActionScript :
var cargador:Loader = new Loader(); 
//Lo agregas a contenedor 
contenedor.addChild(cargador); 
//Esperas a que se cargue por completo
cargador.contentLoaderInfo.addEventListener(Event.COMPLETE,onLoadComplete);
cargador.load(new URLRequest("url")); 
//Creas la funcion que escucha la carga
function onLoadComplete(e:Event){
   //Manipulas el ancho y alto del swf cargado
   cargador.content.width = 100;
   cargador.content.height = 100;
   //Podrias agregar directamente el swf a tu contenedor y no el loader si esto te ayuda mas
   //solo eliminas la linea de arriba donde agregas el cargador al contenedor 
   contenedor.addChild(MovieClip(cargador.content));
}
 Una forma mas facil seria dandole al contenedor el mismo tamaño que el del swf a cargar osea si el swf mide 1024*768 tu contenedor mide lo mismo y al agregar a escena tu contenedor lo escalas al tamaño que quieras y al momento de que le agregas el swf este tmb se escalara. (Este modo pensando que hagas el contenedor en el editor)