Si el problema es que no se te pone a pantalla completa al inicio, tienes 2 soluciones, si estás haciendo una aplicación web, vas a necesitar que el usuario haga click en algún sitio para que se pueda poner en pantalla completa, si por el contrario es para un desktop app (que creo que es tu caso), tienes que indicarle a flash, que cuando te haga el .exe, considere que es una app a pantalla compelta.
Si este no es tu problema, por favor ilumínanos un poco más.
Un saludo.