ejecutar un php desde el servidor

hola, tengo un problema haciendo mailing, resulta q tengo una base de datos con 3000 emails los cuales los envio mediante smtp. el problema es q la ejecucion es muy lenta xq el servidor manda de a 100 por hora, creo q esta bien explicado x lo menos es lo q entendi de un amigo q me vino con el problema. Una solucion q encuentro aunque no se si es posible es la de ejecutar el php q hace la tarea de mailing directamente desde el servidor, de esta manera el usuario no tiene q dejar abierto el navegador las 30 horas necesarias para poder completar la tarea.
Alguien me podria explicar como hacer esto o decirme cual es el problema ?
Muchas gracias

Agrega un job a cron si el servidor es Linux/Unix o a las tareas programadas de Windows.