BuenAS:
Pues... básicamente, las cosas de Flex. Imagino que te refieres a assets incrustados con @embed. Cuando la aplicación crece en número de componentes, Flex suele olvidarse de refrescar algunos de ellos. En función de la complejidad, aplica de menor a mayor las siguientes acciones

:
1. Cerrar y volver a abrir el componente en la vista de diseño.
2. Seleccionar Project/clean.
3. Cerrar el proyecto y volverlo a abrir. Si tienes muchos proyectos abiertos, cierra los que no estés utilizando (todo ayuda).
4. Borrar el proyecto (sin borrarlo de tu workspace, repito SIN BORRARLO DE TU WORKSPACE) y volviéndolo a importar.
5. Hacer un esfuerzo e imaginarte tú en ese marco que muestra Flash builder que está la imagen

A mí particularmente con proyectos AIR, cuando crecen un poco de tamaño... casi siempre aplico el pto. 5. Últimamente, desde que nos pasamos a Flash Builder en el curro, no recuerdo que me haya ocurrido (cruzo los dedos)
Un saludo.