BuenAS:
Creo que, a fecha de hoy, es imposible abrir un proyecto Flash Catalyst con Flash CS4 (o Flash CS5). Lo que sí puedes hacer es el camino inverso: crear un swf con tu MovieClips/Sprites e importarlo desde Flash Catalyst. Pero esto es algo similar a incrustar o cargar un swf desde una aplicación Flex.
El flujo de trabajo lógico para Flash Catalyst es que la parte gráfica la hagas con Illustrator/Photoshop, importes los assets en Flash Catalyst para dotarlos de interacción y, si se requiere una programación más compleja, recurras a Flash Builder.O sea, que recorras casi toda la suite CS5

Flash Builder sí permite abrir un proyecto Flash Catalyst y modificarlo a voluntad; de hecho, el código que subyace bajo él no es otra cosa que mxml -el framework Flex más otras librerías de Flash Catalyst-.
Un saludo.