Para seguir con los problemas, lo que me sucede ahora es que cuando hago dos consultas separadas a la base de datos, solo funciona la primera, no la segunda, independientemente de cual sea la que este en primer lugar.
Este problema ya me habia pasado y era porque no cerraba bien la conexion con mysql_close($link).
El tema es que ahora estoy usando los metodos de mysqli para que me funcionen los stores que tengo en la base. Y no se si por ahi hay alguna forma de cerrar la conexion de manera definitiva que no funciona con el $mysqli->close();
Mi duda es que a lo mejor como inicie la conexion con $mysqli = mysqli_init(); y la conecte con $mysqli->real_connect no se si me hace falta algo mas para que pueda ejecutar dos consultas completamente separadas a la misma base de datos... se entiende?