Mirá lo del HTML vs. Flash es la eterna discusión. Si buscás por este foro vas a encontrar mucha tela al respecto. El punto es que, elijas el sistema que elijas tratá de aprovecharlo al máximo. Por ejemplo, si tenés muchas galerías de fotos y contenidos de videos, flash es una herramienta que te puede ayudar mucho. Es cierto que hoy en día se pueden hacer muchas cosas sin necesidad de recurrir a flash, pero como dije, tampoco es que está mal usarlo. Ahora, si lo vas a usar, que funcione perfecto. Si no, andá a lo básico, que lo importante en tu sitio es la información, después de todo.
El tema con el lenguaje que elijas es, como decía, aprovecharlo. Por ejemplo, para evitar el tema de que si se ve chiquito o no, podés directamente hacer que el stage te ocupe todo el espacio del navegador y después centrar la película. De esa manera, se va a ver siempre del mismo tamaño. Eso en cuanto a lo técnico.
En cuanto al diseño, lo que veo es que hay muchas cosas pasando todo el tiempo. Eso hace que todo se vea desordenado y distrae. Dos consejos que podrían ayudarte son:
1. no le tengas miedo al "espacio en blanco". Es decir, no atiborres todo de cosas. Por ejemplo, en lugar de poner tantas cosas de fondo adentro del espacio donde está la información, podrías jugar con un fondo que rodee la película.
2. Sistematizá y ordená. Esto significa poner criterios para cada cosa. Ahora, cada página tiene su propia diagramación, y eso hace que parezca improvisado. Como si hubieras puesto cada cosa donde te entraba, o que agarraste muchos efectos lindos que había por ahí y los pusiste todos. En un lado hay fades, en otro hay sliders... hay fondos de diferentes colores, otros con textura de fondo...
Además, usá la misma tipografía para los mismos elementos, los mismos tamaños para las mismas cosas (o sea, todos los textos corridos deberían ir iguales). Eso crea consistencia y permite que el usuario se concentre en el contenido y no en "reaprender" donde está cada cosa cada vez que cliquea un link.
Por último, otro consejo que puede ayudarte es que indiques de alguna manera los links externos a la página, como el foro.
Bueno, ya hablé mucho, como de costumbre... jajajaja