Entiendo entonces según el artículo que la unica manera de hacerlo es usando el SWFObject y evitando el uso del embed.
Encontré un sitio que decia algo sobre un archivo robots.txt en la raiz del sitio:
otros foros escribió:
La técnica consiste en crear un archivo de texto plano llamarlo robots.txt y subirlo al root de tu sitio.
Si el archivo Flash tiene por nombre movie.swf el contenido de tu archivo robots debe verse así:
Código :
User-agent: *
Disallow: /movie.swf
En las paginas de ayuda de google encontre esto
http://www.google.com/support/webmasters/bin/answer.py?answer=35303