Este es un problema poco atendido y muy común.
Al descargar un theme para tu Compiz Fusion en Linux (Ubuntu) te sale una extensión como la siguiente: *.cgwdtheme y no puedes instalar ese theme.

Para correrlo en Compiz Fusion solo renombra su extension a *.emerald y abrelo con el emerald theme manager. Asi de simple.

Suerte.