Upload files with php en servidor linux

Buenos dias, tengo el siguiente problema, cree una aplicacion el flash en la cual usando la clase filereference guardo un archivo en una carepeta de mi computador, para esto uso un script en php :
<?php
$uploadDir = './';
$uploadFile = $uploadDir . $_FILES['Filedata']['name'];
move_uploaded_file($_FILES['Filedata']['tmp_name'], $_POST['filename']);
?>

esto me funciona perfecto cuando lo ejecuto en windows,
ahora que estoy usando un servidor en linux cuando cargio un archivo me saca un error y no me crea ela rchivo en la carpeta que querio, la sintaxis del php cambia dependiendo del sistema operativo???

¿Qué error?.

Error #2044: Unhandled IOErrorEvent:. text=Error #2038: File I/O Error.

que estas usando para subir los archivos?
html?flash?javascript?