Si cargas tu película en el _root destruyes la anterior.
Código :
loadMovie("tuPeli.swf", _root);
Ahora, ten en cuenta que el tamaño del swf será el de la primera película a no ser que cambies el tamaño con JavaScript. Vi algo en After-Hours, así que date una vuelta por allí y busca.
Yo he encontrado esto que probablemente te sirva.
http://www.e-tonilopez.com/after-hours/archives/000383.html
Un saludo!!