Con un pop-up... eso es javascript.
Yo uso este script no me lo bloquea casi ningun navegador o bueno hasta ahora no he tenido problemas con el:
Código :
<a href="TU_POPUP" target="v" onclick="window.open(this.href, this.target, 'width=840,height=680');return false">Ver Popup</a>
Width y Height son el ancho y alto de tu SWF
TU_POPUP es el archivo que quieras Abrir
Pruebalo y comentanos si te sirvió