ordenes del jefe?

Deberías hacerle ver al jefe, que el experto eres TU, y que tú eres el único que sabe lo que es más apropiado para su WEB.
Yo, soy estudiante de arquitectura, y si un cliente, el día de mañana, me pide una casa con menos pilares de los necesarios, tendré que decirle que se ponga como se ponga, eso no se puede hacer, pues conlleva un riesgo para él, que yo, como responsable de la obra, no puedo asumir.Debes hacerle entender, que los popups no son la manera de proceder.
En la mayoría de las ocasiones, los clientes quieren a un EXPERTO que les transmita seguridad.
Otra cosa es, que te pida una cosa, y no sepas convencerle de lo contrario, lo cual es doblemente problemático (porque no le convences, y te restas "credibilidad" y "seguridad")
Te aseguro, que si una empresa contrata a un GRAN WEBMASTER, y este les dice lo que es mejor para su WEB, la empresa no le va a poner muchas pegas.
Y si no... te lo explico a la manera "egoista".
¿crees que eso te va a ayudar en tu carrera profesional?
Porque si la gente que visita tu WEB, ve cómo trabajas... quizá se replantees contratarte.
Ya no sólo es cuestión de sumisión al contratante, sino de qué apariencia se quiere dar hacia futuros (o potenciales) clientes.
Suerte.