php-apache-mysql y java-iplanet-mysql

Espero que alguien me pueda ayudar, tengo un servidor linux en el cual existen estas dos configuraciones corriendo en web una es php-apache-mysql y la otra java-iplanet-mysql, existen 2 instancias de mysql yo quisiera que mi lenguaje php conectarme a la instancia de mysql que esta configurada con java-iplanet-mysql pero no se si se pueda o existan alguna manera de poder hacerlo, les agradeceria mucho la ayuda.

atte.
Victor M . Morales Gabriel

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