Pues bien mira te comento.
Flash es realmente impresionante y los limites los pones tu e aquí algunas cosas que creo que debes de tomar en cuenta:
Eso de que no lo lee google es un error ya que incluso aquí hay varios tutoriales en los cuales te indica de que forma los puede encontrar google
La parte de que es muy costoso o laborioso el modificar las paginas depende realmente de ti que tan complejo o sencillo desees hacer, ya que puedes crear desde administradores de contenido, textos que se manden a llamar externamente, galerías etc... un mundo de posibilidades q solo es cuestión que tu análisis de lo que realmente necesites sea el mejor y la forma mas adecuada
Diría Adidas "Nada es imposible"
Ahora cabe mencionar que cualquier tecnología tiene sus pros y sus contras y todo dependerá al mercado y la forma en que te quieras dirigir, el tiempo y esfuerzo que desees dedicar sera igual al resultado que obtendrás.
Espero que todo esto te sirva un poco y te abra un poco el panorama, afortunadamente hay mucha información en la red que te ayudan con todo lo relacionado a lo que desees hacer la cuestion es no desesperar hasta alcanzar tu meta.
Suerte y esperemos que pronto nos presumas tu web site .
Saludos.