Archivo/opciones de exportacion
ahi hay que tildar la opcion de proyector windows.
luego archivo/exportar y se genera el .exe, que en realidad es un swf con capacidad de ejecutarse sin flash player, ni instalacion alguna.
yo uso el flash CS5, pero en el CS3 y el CS4 creo que era lo mismo.
los demas no se...
espero haber ayudado