Ja! nosé como hagan los "pros" esto pero yo tengo un método bien fácil para solucionar tu problema.
Crea un botón invisible (quiere decir un botón con sólo la "zona activa") del tamaño de tu pop up, este boton debe estar en UNA CAPA AL FINAL DE TODO TU popup.
Si pruebas ahi la película, notarás que el mouse ahora ya no reconoce los botones de abajo, pero si reconoce al boton nuevo que haz creado (lo notarás por la manito) para ocultar la manito debes ponerle un nombre de instancia al boton, por ejemplo "boton1", luego, situate en el primer fotograma de tu POP UP, y pondrás este código:
boton1.useHandCursor = false;
Con eso ocultas la manito al pasar sobre ese boton, y al mismo tiempo "tapas" los botones inferiores.
Espero haberte ayudado