buenas. te conviene hacerlo directamente a la comunicacion por medio de una libreria, por ejemple AMFPHP, en esto, solo debes en flex crear la conexion y enviar los datos a la clase php q se encargara de todo lo demas. puedes ver un buenos ejemplos en español aqui y uno mas elaborado aqui. uno bastante bueno en ingles puedes verlo aqui; saludos
yo te diria q es mucho mejor pasarlo a un php, de esa forma no te limitas para nada, ya que podes usar el mismo archivo paa diferentes cosas si tener q llamarlo a cada rato. saludos