Hola Lerenetc!
Pues la verdad no sabría decirte, con Flash obviamente puedes hacerlo todo y claro, los resultados visuales finales son mucho mejores que con PHP solamente por regla general.
La cuestión es cuanto dinero este dispuesto a invertir tu cliente creo yo, pero desde mi punto de vista es obvio que Flash + PHP es más caro (bastante más) que PHP a secas.
Lo que sí podrías hacer es una combinación de ambos que siempre he pensado que queda muy bien. Es decir, la página maquetada en PHP y luego la cabecera, el menú, una galería o book... pues hacerlos en Flash.
Deu!!