Sistema de archivos

Me gustaria saber que comandos puedo utilizar para poder crear carpetas, mover, copiar y borrar archivos en un server, les explico que la idea mia es hacer un disco virtual con flash y el tutorial que sale aqui para subir archivos esta muy bueno pero me gustaría agregarle esas funciones

Pues NO puedes solo con flash, necesitarás apoyarte en algún lenguaje de servidor como PHP / ASP

Flash es una aplicación del lado del cliente, y tu quieres trabajar en el servidor.