Si tu swf tiene imágenes, vas a la biblioteca y al darle click derecho a cada una, te metes en propiedades, y le asignas abajo un porcentaje.
Si tu swf tiene sonidos, también puedes optimizarlos uno por uno, en la biblioteca, pero en términos de compresion de sonido.
Si tienes videos importados... dificil

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Si solo tienes vectores, te hago la siguientes recomendaciones:
1. Trata de reutilizar símbolos: si ves que hay cosas que se repiten mucho, mejor convierte una de ellas en símbolo (mc o grafico, segun necesites) y la colocas en cada punto que la requieras. Con esto, flash solo toma el peso del símbolo una sola vez en toda la pelicula, y lo puedes reutilizar cuantas veces quieras, sin preocuparte por el peso.
2. Si son vectores complejos: por ejemplo, imágenes que se han "trazado mapa de bits", o cosas por el estilo que en realidad no vienen siendo vectores hechos en flash, pues trata de "calcarlos" o redibujarlos en flash... con esto, el peso baja dramáticamente.
3. Si has trabajado con fuentes complejas, es normal que el peso suba un poco. Trata de usar fuentes "estandar" como arial, times NR, verdana o Trebuchet MS.
O bueno, dame una descripción de tu .fla y te digo más especificamente que necesitas.
Un saludo!.