Hola Basitante
Bien, imagino que estas llamando al formulario.swf atravez de LoadMovie, si es asi, por eso es que se ve principal.swf detras de formulario.swf, lo que puedo recomendarte es que lo llames de manera externa, es decir, abrir un archivo desde flash, de la siguiente manera:
http://www.cristalab.com/tutoriales/109/ejecutar-y-abrir-archivos-externos-desde-flash
dentro del tutorial encontraras los pasos, ya solo le cambias la extension del archivo, en vez que sea *formulario.exe", le puedes poner "formulario.swf
espero que te sirva y suerte