Hace menos de un mes, F dejó un link para este asunto (búscalo). Por otro lado, en mi experiencia, la mejor opción es vmware (también hay bastante sobre este tema en el foro), el wine me consume demasiada memoria... el vmware no. Una de las diferencias entre ambos, es que con el vmware necesitas el CD (licencia si lo quieres tener legal) de windows, con el wine, no. Repito, el rendimiento de mi PC baja increiblemente con wine, con vmware no.
En tu máquina virtual (si te decides por probar el
vmware) podrás instalar flash (y el resto de programas para win) sin problemas.