Bienvenida!
Bueno, yo personalmente te sugiero que todo lo que tengas programado con Popups lo quites, las nuevas versiones de Internet Explorer bloquean Popups igual que hace Firefox, ya que se trata la Popup como una interferencia en la navegación del usuario... o sea, como algo MALO.
En tutoriales hay una guía de usabilidad en Flash míratela que seguro que te ayuda

Un saludo!!