nose cual sea tu caso especificamente, pero a mi me ha salido ese mensaje cuando:
--Cargo el swf directamente de forma local
--Cargo un html que solo contiene swf
Me imagino que pasa porque el iexplorer solo encuentra un solo objeto en este caso el swf.
Posibles soluciones:
1. subirlo a un host y verlo ahi. el i explorer no rechista cuando lo cargas desde un host, aun cuado sea directamente el swf (almenos en mi caso)
2. La mejor opcion:

Pd. asegurate de tenerlo como navegador predeterminado, para que cuando hagas tus previews en navegador desde flash, lo haga con firefox y no tengas que estar desactivando molestas opciones como en el iexplorer.