si se puede
...
que querias que te dijese como?
ok
esto se hace en el HTML donde agregaras:
1. Agrega el siguiente parameto en el tag OBJECT:
<param name="wmode" value="transparent">
2. Y este en el tag EMBED:
wmode="transparent"
si lo que quieres hacer es que sea transparente en el escritorio
existe un aplicacion que hace eso
Zinc 
