Hice alguna animacion swf con swish (cuyo fondo tenía color, por ejmplo, azul) y al cargarla como pelicula externa en una animación flash (cuyo escenario tenia color blanco) el swf hecho con swish me salia con el fondo blanco de la animación flash, o sea, me salia como si el swf original del swish hubiese sido creado transparente en vez de con el fondo azul.
Pues mira eso sucede por que al cargarlo desde otra película, adquiere las propiedades de la película que la cargo como es el caso de el color de fondo, y la velocidad de frames, mira si lo que necesitas es que salga con un fondo de color azul simplemente en el swish crea un rectángulo del color de fondo que necesites y colocalo en tu ultima capa, así es, ese rectangulo va ser tu fondo, para que cuando lo importes aparezca con el.